红斑狼疮的发病原因目前尚未完全明确，但一般认为与遗传、环境、雌激素等多种因素有关。遗传方面，有研究显示，红斑狼疮患者的一级亲属（父母、子女以及兄弟姐妹）中，患病风险比普通人群高。比如，有红斑狼疮患者的家族，其亲属患红斑狼疮的概率大约是无红斑狼疮家族史人群的5倍左右。
遗传因素影响
基因携带倾向： 红斑狼疮具有一定的遗传易感性，某些特定基因的携带会增加发病风险。例如，人类白细胞抗原（HLA）系统中的一些基因与红斑狼疮的发病相关。如果家族中有直系亲属患有红斑狼疮，那么其他家族成员就需要多留意自身身体状况，定期进行相关检查。遗传模式特点： 它不是简单的孟德尔遗传方式，而是多基因遗传，多个基因的相互作用以及与环境因素的共同作用才会导致发病。所以即使家族中有红斑狼疮患者，也不是肯定会发病，但相比其他人患病几率更高。
环境因素作用
紫外线照射影响： 紫外线是诱发红斑狼疮的重要环境因素之一。大约有1/3的红斑狼疮患者在日晒后会病情加重或复发。比如，长期从事户外工作，经常暴露在阳光下的人，患红斑狼疮的风险相对较高。紫外线可以使皮肤细胞的DNA发生改变，产生抗原性物质，从而引发免疫系统的异常反应。感染因素关联： 某些病毒感染可能与红斑狼疮发病有关。比如EB病毒、C型肝炎病毒等感染，可能会触发自身免疫系统的异常激活，进而导致红斑狼疮的发生。当人体感染这些病毒后，免疫系统识别错误，把自身组织当成外来入侵物进行攻击，就可能引发类似红斑狼疮的免疫紊乱情况。
雌激素的影响
女性发病优势： 红斑狼疮在女性中的发病率明显高于男性，尤其是在育龄期女性中更为常见。这与雌激素水平密切相关。雌激素可以影响免疫系统的功能，在青春期、孕期等雌激素水平变化较大的时期，女性体内雌激素水平升高，可能会促使免疫系统出现异常，增加红斑狼疮的发病几率。比如，育龄女性体内雌激素波动较大，相比男性和儿童，更容易受到雌激素影响而患上红斑狼疮。雌激素调节机制： 雌激素可能通过影响B淋巴细胞、T淋巴细胞等免疫细胞的功能，调节自身抗体的产生等过程。它可以刺激B细胞产生更多的自身抗体，这些自身抗体与体内相应抗原结合形成免疫复合物，沉积在组织器官中，引发炎症反应，导致红斑狼疮相关的皮肤、肾脏、关节等多器官受损的表现。