自身免疫病并不都很严重。比如甲状腺功能亢进症这类自身免疫病，经过规范治疗，多数患者可以控制病情，像抗甲状腺药物治疗有效率能达到一定比例。
自身免疫病的不同类型表现
1. 相对较轻的自身免疫病
类风湿关节炎早期： 部分患者可能仅出现关节轻度疼痛、肿胀，经过及时治疗，如使用非甾体抗炎药等，病情能得到较好控制，对日常生活影响相对较小。局限性硬皮病： 有些患者仅表现为局部皮肤硬化，病变范围局限，若能早期干预，病情进展缓慢，对内脏器官影响较小。
2. 可能较严重的自身免疫病
系统性红斑狼疮： 病情严重时可累及多个脏器，如肾脏受累可出现蛋白尿、水肿，甚至发展为肾功能衰竭；血液系统受累可导致贫血、血小板减少等。重症肌无力： 严重情况下会影响呼吸肌，导致呼吸困难，需要机械通气维持生命，这是比较危急的情况。
3. 自身免疫病的病情变化特点
病情可波动： 自身免疫病的病情不是固定不变的，有的患者在某些诱因下（如感染、劳累等）病情会加重，而在规范治疗及避免诱因后病情又能缓解。例如系统性红斑狼疮患者，在阳光暴晒后可能出现病情复发，出现皮疹、关节疼痛加重等表现。个体差异大： 不同患者患同一种自身免疫病的严重程度差异很大。比如类风湿关节炎，有的患者仅出现几个关节的轻度病变，而有的患者会很快出现多个关节的畸形、功能丧失。