治疗疱疹常用的药物有阿昔洛韦、伐昔洛韦等。一般来说，抗病毒药物能有效抑制疱疹病毒复制，缩短病程。
口服抗病毒药物
阿昔洛韦： 属于广谱抗病毒药，能干扰疱疹病毒DNA多聚酶，抑制病毒复制。可用于初发或复发性皮肤、黏膜疱疹感染。伐昔洛韦： 是阿昔洛韦的前体药物，口服后在体内转化为阿昔洛韦发挥作用，生物利用度比阿昔洛韦高，服用相对更方便，对单纯疱疹病毒等有较好的抑制作用。
外用抗病毒药物
阿昔洛韦乳膏： 局部外用可治疗单纯疱疹、带状疱疹感染。直接涂抹在疱疹患处，能在一定程度上减轻症状，抑制病毒在局部的复制。喷昔洛韦乳膏： 同样用于口唇或面部单纯疱疹、生殖器疱疹。它能选择性抑制疱疹病毒DNA聚合酶，从而起到抗病毒的作用。
免疫调节药物
对于反复发作的疱疹患者，可能会用到免疫调节药物。比如转移因子口服液，它可以调节机体免疫功能，增强机体抵抗疱疹病毒的能力，帮助减少疱疹的复发次数，但使用时需在医生指导下根据患者具体免疫情况来决定是否适用。不过这类药物使用需要谨慎评估患者的免疫状态等情况，不是所有疱疹患者都适用。
对症缓解疼痛药物
如果疱疹患者伴有明显疼痛，对于成年人可以在医生指导下使用对乙酰氨基酚等非甾体抗炎药来缓解疼痛，但儿童使用需特别谨慎，要根据体重等情况严格按医嘱使用，因为儿童的肝肾功能等发育尚未完全成熟，药物代谢等与成人不同。而对于严重的神经痛等情况，可能还会涉及其他更专业的止痛处理，但一般先从相对安全的基础药物开始考虑。