巧克力囊肿术后打针可能会有一些副作用，具体情况因人而异。以下是一些可能的副作用：
1.更年期症状：打针可能会导致更年期症状，如热潮红、夜间盗汗、情绪波动等。
2.骨质疏松：打针会抑制卵巢功能，减少雌激素的分泌，从而增加骨质疏松的风险。
3.心血管疾病：长期使用雌激素可能会增加心血管疾病的风险。
4.头痛、乳房胀痛：打针可能会引起头痛、乳房胀痛等不适症状。
5.体重增加：打针可能会导致体重增加。
6.其他：打针还可能会引起恶心、呕吐、疲劳、失眠等不适症状。
需要注意的是，这些副作用并不是一定会发生的，而且大多数副作用都是暂时的，会在停药后逐渐消失。在打针期间，患者应该密切关注自己的身体状况，如果出现严重的不适症状，应该及时就医。
此外，巧克力囊肿术后打针需要在医生的指导下进行，患者应该按照医生的建议进行治疗，不要自行增减药量或停药。同时，患者还应该注意休息，保持良好的生活习惯，有助于身体的恢复。