怀孕时出现畸形胎儿的原因主要有以下几点：
1.遗传因素：
染色体异常：染色体异常是导致胎儿畸形的最常见原因之一。父母双方或一方的染色体结构或数量异常，可能会传递给胎儿，从而导致畸形。
基因突变：基因突变是指基因序列中的突然变化。某些基因突变可能会影响胎儿的发育，导致畸形的发生。
2.环境因素：
化学物质：孕妇在怀孕期间接触某些化学物质，如农药、有机溶剂、重金属等，可能会干扰胎儿的发育，导致畸形。
辐射：孕妇在怀孕期间接受过多的辐射，如X射线、放射性物质等，可能会导致胎儿畸形。
药物：某些药物，如抗生素、抗癫痫药、抗肿瘤药等，在怀孕期间使用不当可能会对胎儿的发育产生影响，导致畸形。
病毒感染：孕妇在怀孕期间感染某些病毒，如风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等，可能会通过胎盘感染胎儿，导致畸形。
3.母体因素：
年龄：孕妇年龄过大或过小，都可能增加胎儿畸形的风险。
疾病：孕妇患有某些疾病，如糖尿病、高血压、甲状腺功能异常等，可能会影响胎儿的发育，导致畸形。
营养缺乏：孕妇在怀孕期间缺乏某些营养物质，如叶酸、维生素A、维生素B12等，可能会影响胎儿的发育，导致畸形。
不良生活习惯：孕妇在怀孕期间吸烟、饮酒、吸毒等，可能会影响胎儿的发育，导致畸形。
4.其他因素：
多胎妊娠：多胎妊娠时，胎儿畸形的风险会增加。
不明原因：有些胎儿畸形的原因目前尚不清楚，可能与多种因素有关。
总之，怀孕时出现畸形胎儿的原因是复杂的，可能是多种因素共同作用的结果。为了减少畸形胎儿的发生，孕妇在怀孕期间应注意保持良好的生活习惯，避免接触有害物质，定期进行产前检查，及时发现和处理问题。