真菌感染是由真菌侵入人体引起的。一般来说，人体免疫力下降时更容易遭遇真菌感染，比如约有5% - 10%的健康人鼻腔中携带念珠菌，但当免疫力低下时就可能引发感染。
一、自身因素导致真菌感染
皮肤屏障受损： 皮肤是人体抵御真菌的第一道防线，如果皮肤出现破损，像割伤、擦伤等，真菌就容易趁虚而入。例如长期卧床的病人，局部皮肤长时间受压、不透气，皮肤屏障功能受损，就较易发生真菌感染。免疫力低下人群： 患有艾滋病、糖尿病等疾病的人，或者长期使用免疫抑制剂的人，免疫力下降，身体抵御真菌的能力减弱，更容易被真菌感染。比如艾滋病患者由于免疫系统严重受损，患肺孢子菌肺炎等真菌感染性疾病的风险大幅增加。
二、环境因素引发真菌感染
潮湿环境滋生： 真菌喜欢在潮湿的环境中生长繁殖，像浴室、游泳池周围等地方，湿度大，就为真菌提供了良好的生存环境。如果个人卫生习惯不好，长时间处于潮湿环境中，皮肤就容易被真菌侵袭。比如经常穿不透气的胶鞋，脚部长期处于潮湿状态，就容易患上足癣。公共场所传播： 在公共浴室、健身房、游泳池等公共场所，真菌可能通过接触传播。比如使用公共拖鞋、毛巾等，就有感染真菌的风险。如果公共设施清洁不彻底，就会残留大量真菌，增加他人感染的几率。
三、医疗操作相关真菌感染
长期住院使用器械： 长期住院的患者，如果需要留置导管，如静脉导管、导尿管等，就可能因为器械表面成为真菌附着的场所，从而引发真菌感染。比如长期留置导尿管的患者，泌尿系统真菌感染的发生率会明显升高。广谱抗生素使用： 长期或大量使用广谱抗生素，会破坏人体正常的菌群平衡，使得真菌失去了其他菌群的抑制，从而大量繁殖引发感染。例如一些患者因病情需要长期使用广谱抗生素治疗细菌感染，之后出现了口腔念珠菌感染等真菌感染情况。