小便痛可能由多种原因引起，比如尿路感染，据统计，女性一生中尿路感染的发生率较高，约50%左右会至少患一次。
尿路感染导致小便痛
膀胱炎引起：细菌感染膀胱是常见原因，会出现尿频、尿急、尿痛，有时还会有血尿。患者会感觉尿道有灼热样疼痛，排尿时明显。肾盂肾炎导致：除了小便痛，还可能有腰痛、发热等症状，是细菌由尿道上行感染到肾盂引起的，疼痛可能较为剧烈。
泌尿系统结石引发
肾结石造成：结石在泌尿系统移动时，会损伤尿路黏膜，引起小便痛，还可能伴有腰腹部绞痛。结石较小的话可能随尿液排出，较大时就会卡在尿路。输尿管结石所致：结石卡在输尿管中，会导致输尿管痉挛，出现剧烈的小便痛，同时可能有恶心、呕吐等症状。
性传播疾病导致
淋病引起：由淋球菌感染所致，男性多表现为尿频、尿急、尿痛，尿道有脓性分泌物；女性症状相对较轻，但也会有小便痛、白带增多等情况。衣原体或支原体感染：也会引起小便疼痛，还可能出现尿道瘙痒等症状，多通过性接触传播。