小便时尿道刺痛可能由多种原因引起。比如尿道炎较为常见，约30% - 50%的非淋菌性尿道炎患者会出现尿道刺痛的症状。
尿道炎导致的尿道刺痛
淋菌性尿道炎： 主要由淋病奈瑟菌感染引起，多通过性接触传播。除了尿道刺痛，还可能有尿频、尿急，尿道口流脓等表现。患者需要及时就医，进行规范的抗感染治疗。非淋菌性尿道炎： 常由衣原体、支原体感染所致，症状相对淋菌性尿道炎稍轻，尿道刺痛程度不一，可能伴有尿道分泌物，量少且为稀薄浆液性。
膀胱炎引发的尿道刺痛
急性膀胱炎： 女性较为多发，主要是细菌感染膀胱引起。除了尿道刺痛，还会有尿频、尿急，严重时可出现血尿。患者需大量饮水，增加排尿次数，帮助冲洗尿道。慢性膀胱炎： 多由急性膀胱炎迁延不愈所致，尿道刺痛症状相对较轻，但会反复出现尿频、尿急等症状，病程较长。
泌尿系统结石造成的尿道刺痛
尿道结石： 多来自肾和膀胱的结石排入尿道。除了尿道刺痛，还可能有排尿困难，尿线变细，甚至出现尿潴留。较小的结石有时可自行排出，较大的结石则需要就医处理。膀胱结石： 主要症状是排尿疼痛、排尿困难和血尿。疼痛可放射至阴茎头部，在排尿过程中，结石移动可能导致尿道刺痛明显。
其他可能原因
尿道损伤： 有尿道器械检查史或外伤史的人可能出现尿道刺痛。如导尿时操作不当损伤尿道，会在小便时感到刺痛，还可能伴有血尿。过敏反应： 对某些物质过敏，如使用某些避孕套、润滑剂等，也可能引起尿道刺痛，同时可能伴有尿道局部红肿等表现。