夜晚咳嗽的原因有多种。一般来说，夜间人体迷走神经兴奋，气道反应性增高，一些呼吸道疾病容易在夜晚加重，从而导致咳嗽。比如，约有40%的咳嗽变异性哮喘患者会在夜间或凌晨出现咳嗽加重的情况。
呼吸系统疾病相关
感冒后咳嗽：
普通感冒康复后，部分人可能会遗留咳嗽症状，尤其在夜晚较为明显。这种咳嗽通常会持续3 - 8周，是因为感冒导致呼吸道黏膜受损，敏感性增高，夜晚时呼吸道分泌物刺激会引发咳嗽。
支气管炎：
急性支气管炎患者在夜晚也容易咳嗽。特别是夜间平躺时，气管内的分泌物会刺激气道，加重咳嗽。慢性支气管炎患者夜间迷走神经兴奋，支气管痉挛，加上夜间痰液积聚，咳嗽会更明显，一般病程较长，有多年反复发作史。
心血管系统疾病相关
左心衰竭：
多见于老年人，当左心衰竭时，夜间平卧后回心血量增加，肺淤血加重，导致肺部气体交换受阻，引起咳嗽，常表现为夜间阵发性咳嗽，严重时可咳出粉红色泡沫痰。
环境因素相关
空气干燥：
如果室内空气湿度较低，低于40%时，夜晚空气干燥会刺激呼吸道黏膜，引发咳嗽。比如在北方秋冬季节，室内如果没有加湿器，很容易出现这种情况。
过敏原刺激：
夜晚睡眠时，如果床上有尘螨等过敏原，人体接触后会引起气道过敏反应，导致咳嗽。据统计，约有20%的咳嗽与过敏原有关，尘螨是最常见的室内过敏原之一。