孩子发烧后嘴巴有疱疹，可能是手足口病、疱疹性咽峡炎等引起的，可使用的药物有以下几种。
1.抗病毒药物：如果是病毒感染引起的，如手足口病或疱疹性咽峡炎，可使用抗病毒药物，如利巴韦林、阿昔洛韦等。
2.解热镇痛药：如果孩子发烧，体温超过38.5°C，可使用解热镇痛药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
3.口腔局部用药：可使用口腔局部用药，如口腔溃疡散、西瓜霜等，以缓解口腔疼痛。
4.抗生素：如果合并细菌感染，可使用抗生素，如头孢克洛、阿莫西林等。
需要注意的是，以上药物均需在医生的指导下使用，家长不能自行给孩子用药。同时，要注意孩子的口腔卫生，多喝水，多吃蔬菜水果，避免食用辛辣、刺激性食物。如果孩子症状持续不缓解或出现其他不适，应及时就医。