怀孕五十天不可以进行药物流产，药物流产的适用时间在怀孕的四十九天以内。
药物流产是通过药物而非手术终止早孕的一种避孕失败的补救措施。目前临床应用的药物为米非司酮配伍米索前列醇，两者联合应用终止早孕完全流产率达90%以上。其适用时间在怀孕的四十九天以内，主要是因为这时子宫不太大，妊娠组织不太多，胎儿也小，容易吸净，手术时间短，出血少。
但需要注意的是，药物流产也有一定的风险和适用条件，如存在药流禁忌证（包括肾上腺及其他内分泌疾病、与甾体激素有关的肿瘤、糖尿病未能控制、心血管系统疾病、青光眼、过敏体质、妊娠剧吐、长期服用抗癫痫药、抗抑郁药等）、不全流产、药流失败、出血时间长、出血量多、继发贫血、感染等。
因此，在进行药物流产前，需要进行全面的身体检查和评估，以确保自身的健康状况适合进行药流。同时，药流必须在有正规抢救条件的医疗机构进行，在医生的指导下进行，切勿自行用药。
此外，如果怀孕五十天不打算继续妊娠，也可以选择人工流产。人工流产包括负压吸引术和钳刮术，负压吸引术适用于妊娠10周以内，钳刮术适用于妊娠11-14周。人工流产的最佳时间一般在妊娠6-8周，因为此时孕囊大小适中，手术难度和风险较低，术后恢复较快。
总之，无论是药物流产还是人工流产，都需要在医生的指导下进行，以确保安全和有效。同时，在进行任何流产手术后，都需要注意休息和护理，避免感染和并发症的发生。如果出现异常情况，如出血过多、腹痛剧烈等，应及时就医。