儿童牙齿矫正有一定风险，但合理矫正一般利大于弊。不过可能存在一些副作用，比如牙齿松动：矫正过程中，牙齿会在牙槽骨中移动，短时间内可能出现轻度松动，这是正常的，一般矫正结束后会逐渐恢复稳固，通常松动程度较轻，不会影响牙齿的长期健康。
牙龈问题风险
牙龈红肿出血：在矫正初期，牙套等装置可能会对牙龈产生刺激，约有10% - 20%的儿童在矫正开始的1 - 2周内会出现牙龈红肿、刷牙时少量出血的情况。这是因为口腔卫生清洁相对困难，牙套周围容易残留食物残渣，引发牙龈炎症。只要及时清洁口腔，保持口腔卫生，这种情况会逐渐改善。牙龈萎缩：如果矫正过程中口腔卫生维护不佳，长期的炎症刺激可能导致牙龈萎缩。但只要严格遵循医生的口腔清洁指导，每天认真刷牙、使用牙线等，可有效降低牙龈萎缩的发生概率，其发生概率一般低于5%。
牙齿敏感风险
牙齿酸痛：儿童牙齿矫正时，施加的矫治力会使牙齿内部的牙髓组织受到一定影响，约30%左右的儿童会出现牙齿对冷热酸甜敏感的情况，表现为吃冷饮或热食时短暂的酸痛感。一般在矫正结束后，牙齿敏感症状会慢慢消失。在矫正期间，可以选择使用抗敏感的牙膏来缓解症状。牙齿脱矿：如果矫正时口腔卫生控制不好，细菌产生的酸性物质可能会导致牙齿表面脱矿，出现白色斑块。约有15% - 20%的儿童可能发生牙齿脱矿。这时候需要加强口腔清洁，必要时在医生指导下进行再矿化治疗来改善。
影响咀嚼和进食风险
咀嚼功能短暂受影响：刚戴上牙套的前1 - 2周，约40%的儿童可能会感觉咀嚼食物不太方便，咬合力有所下降，进食速度会变慢。这是因为牙齿还不适应新的矫治力，随着时间推移，儿童会逐渐适应，一般1 - 2周后这种情况会明显改善。在此期间，应尽量吃软食，避免吃坚硬、黏性大的食物，防止牙套损坏或影响矫正效果。