胃肠道不适
山楂中含有较多的有机酸，如山楂酸、柠檬酸等，过量食用会刺激胃酸大量分泌。对于一般人群而言，可能会出现反酸、烧心、胃痛等症状。而对于本身就有胃肠道疾病的人群，比如患有胃溃疡、胃炎的人，山楂吃多了会加重病情，因为过多的胃酸会进一步损伤胃黏膜，导致病情恶化。例如，有研究表明，长期大量食用山楂的人群，胃肠道不适的发生率明显高于正常饮食人群。
血糖波动
山楂中含有一定量的糖分，虽然属于天然糖分，但如果食用过量，对于糖尿病患者或者血糖调节能力较差的人群来说，会引起血糖的较大波动。糖尿病患者本身血糖调节机制异常，食用过多山楂后，血糖会迅速升高，不利于血糖的控制，可能会诱发一系列并发症。一般人群如果短时间内大量食用山楂，也可能导致血糖短时间内上升，长期如此可能增加患糖尿病的风险。
牙齿损伤
山楂较酸且质地坚硬，吃多了会对牙齿造成一定损伤。酸性物质会腐蚀牙齿的牙釉质，使牙齿的硬度降低，长期下来容易导致牙齿敏感、龋齿等问题。尤其是儿童，他们的牙齿还在发育阶段，牙釉质相对较薄，更容易受到山楂的损伤。比如儿童食用过多山楂后，可能会出现牙齿酸痛、蛀牙等情况。
影响营养吸收
大量食用山楂可能会影响其他营养物质的吸收。山楂中的有机酸会干扰人体对一些矿物质的吸收，例如钙、铁等。对于正处于生长发育阶段的儿童和青少年，以及孕妇等需要充足营养的人群来说，会影响身体对营养的正常摄取，进而影响身体健康。比如儿童长期大量吃山楂，可能会导致缺铁性贫血等营养缺乏性疾病。
加重身体负担
山楂吃多了会加重胃肠道的消化负担，因为山楂中的某些成分需要胃肠道花费更多的能量去消化分解。对于老年人或者胃肠功能较弱的人群，本身消化功能就相对较差，食用过多山楂后，容易出现腹胀、消化不良等症状，进一步影响身体的整体状态。例如老年人食用过量山楂后，可能会出现长时间的腹部不适，影响食欲和生活质量。