脑血管造影是一种有创检查，虽然它能帮助医生清晰地了解脑血管的情况，但也存在一定危害。一般来说，其发生严重危害的概率较低，约在1%~2%左右，但仍需重视。
对比剂相关危害
过敏反应： 部分患者可能对造影剂过敏，轻者出现皮疹、瘙痒、恶心等症状，重者可能发生过敏性休克，危及生命。不过现在使用的非离子型对比剂大大降低了过敏反应的发生率，但仍不能完全排除。肾功能影响： 对比剂需要通过肾脏排泄，可能对肾功能有一定影响，尤其是本身肾功能不全的患者。一般使用造影剂后，需要大量饮水促进排泄，以减少对比剂对肾脏的损害，有研究显示约有0.5%~1%的患者可能出现对比剂肾病。
穿刺部位相关危害
出血与血肿： 在进行脑血管造影时需要穿刺血管，可能会出现穿刺部位出血，形成血肿。小的血肿可能会自行吸收，大的血肿可能会压迫周围组织，需要进一步处理。一般发生率在2%~5%左右。血管损伤： 穿刺过程中有可能损伤血管，导致血管壁撕裂、夹层等情况。虽然这种情况相对较少，但一旦发生可能需要进行相应的血管修复治疗。
神经系统相关危害
脑梗死： 操作过程中可能有血栓或空气等进入脑血管，导致脑梗死。这种情况发生概率较低，约为0.1%~0.5%，但一旦发生可能会引起相应的神经功能缺损症状，如偏瘫、失语等。脑出血： 也有极个别情况可能在脑血管造影后出现脑出血，可能与操作过程中对脑血管的刺激等因素有关，发生率非常低，约在0.1%以下。
其他潜在危害
感染风险： 虽然发生概率很低，但穿刺部位存在感染的可能，一般在严格的无菌操作下，感染发生率可控制在很低水平，约0.1%左右。另外，患者在检查后需要密切观察自身情况，如出现头痛、头晕、肢体活动异常等不适症状，应及时告知医生进行处理。