慢性咽炎可能引发多种并发症，需引起重视。
引发邻近器官病变
慢性咽炎若不及时控制，炎症可波及喉部，导致喉部黏膜充血、水肿等，影响发声功能；还可能累及耳部，引发中耳炎，出现耳痛、耳鸣、听力下降等症状，这是因为咽部与耳部通过咽鼓管相通，炎症易经此蔓延。
影响呼吸道健康
炎症刺激可使呼吸道防御功能下降，易引发支气管炎，出现咳嗽、咳痰等症状，长期慢性咽炎还可能进一步发展为肺炎，尤其在免疫力较低的人群中更易发生。
导致全身免疫功能紊乱
长期慢性咽炎会使身体处于慢性炎症状态，影响免疫系统的正常功能，可能导致患者容易反复感冒，且感冒后恢复时间延长，因为免疫系统长期受炎症干扰，无法高效发挥作用。
对心理状态产生影响
慢性咽炎导致的咽部不适、咳嗽等症状长期存在，会给患者带来心理压力，引发焦虑、抑郁等不良情绪，而心理状态欠佳又可能进一步加重咽部不适，形成恶性循环，尤其对于长期处于紧张工作或生活中的人群，这种影响更为明显。