肝癌筛查常用的检查有血清学检查和影像学检查等。一般来说，血清学检查中的甲胎蛋白（AFP）检测是常见项目，而影像学检查包括超声、CT等。
血清学检查方面
甲胎蛋白检测：甲胎蛋白是一种糖蛋白，正常人体内甲胎蛋白含量很低。在肝癌筛查中，若血清甲胎蛋白浓度升高，尤其是持续升高且排除妊娠、生殖腺胚胎瘤等情况时，需高度警惕肝癌可能。一般检测费用在几十元左右。其他血清学指标：除甲胎蛋白外，还有异常凝血酶原等指标也可作为辅助筛查项目，但临床应用相对甲胎蛋白没有那么普遍。
超声检查方面
常规超声：超声检查是肝癌筛查的常用方法之一。它具有操作简便、价格相对较低、可重复性强等优点。一般来说，超声检查可以发现肝脏内直径1厘米左右的占位性病变。在筛查时，患者需要空腹，以便更好地观察肝脏情况。超声造影：对于常规超声发现可疑病灶但难以明确诊断的情况，可进一步做超声造影检查。超声造影能够提高微小病灶的检出率，更清晰地显示病变的血供情况，有助于鉴别肝脏占位是良性还是恶性。
CT检查方面
平扫CT：CT平扫可以初步观察肝脏的形态、大小、密度等情况，发现肝脏内的占位病变。但是对于一些小的肝癌病灶，可能容易漏诊。增强CT：增强CT是肝癌筛查的重要手段。通过静脉注射造影剂，使病变组织与正常肝组织在不同时相的强化程度不同，从而更清晰地显示病灶，提高肝癌的检出率。一般增强CT检查费用相对超声等稍高，大概在几百元不等。
MRI检查方面
MRI平扫：磁共振成像（MRI）对软组织分辨率高，平扫时可以多方位成像，对肝脏病变的检出有一定优势。增强MRI：增强MRI在肝癌筛查中也有重要价值。其造影剂的使用同样可以观察病灶的强化特点，对于鉴别肝癌与其他肝脏占位性病变有重要意义。不过MRI检查费用相对较高，一般在几百元到上千元不等。