肚脐眼痛可能由多种原因引起，比如肠道蛔虫症，儿童相对更易发生，据统计约有10%-20%的儿童曾有过肠道蛔虫感染相关腹痛情况。
肠道寄生虫感染
蛔虫感染： 当人体感染蛔虫后，蛔虫在肠道内活动可能会引起肚脐眼周围隐痛。蛔虫是常见的肠道寄生虫，儿童由于卫生习惯等因素相对更易感染。绦虫感染： 绦虫寄生在肠道也可能导致肚脐眼附近不适。绦虫可通过食用未煮熟的含有绦虫幼虫的肉类而感染人体。
消化系统疾病
肠炎： 多种原因可引起肠炎，如细菌感染、病毒感染等。细菌感染引起的肠炎可能出现肚脐眼周围疼痛，同时还可能伴有腹泻、发热等症状；病毒感染引起的肠炎也可能导致肚脐眼附近疼痛，病程一般在1-2周左右。肠痉挛： 饮食不当、腹部着凉等都可能引发肠痉挛，表现为肚脐眼周围阵发性的疼痛，疼痛程度可轻可重，发作时间一般较短，数分钟至数十分钟不等。
其他原因
腹壁肌肉拉伤： 如果近期有过剧烈运动或者不当的姿势导致腹壁肌肉拉伤，也可能出现肚脐眼周围疼痛。比如进行仰卧起坐等运动时姿势不正确，就可能引起腹壁肌肉拉伤而致痛。泌尿系统问题： 输尿管结石等泌尿系统疾病有时也会放射至肚脐眼周围疼痛。输尿管结石引起的疼痛往往比较剧烈，呈绞痛样，同时可能伴有尿频、尿急、血尿等症状。