木棉花具有一定的药用价值，其花、皮、根均可入药。木棉花有清热利湿、解毒止血等功效。例如，在民间常用于治疗泄泻、痢疾等病症。
清热利湿方面
用于暑湿泄泻：木棉花能帮助缓解因暑湿之邪引起的泄泻症状。在一些传统的方剂中，常将木棉花与其他清热利湿的药物配伍使用。比如与淡竹叶等搭配，对于暑湿导致的腹泻有一定的改善作用。改善湿热黄疸：木棉花对湿热黄疸也有一定的辅助调理作用。它可以通过清热利湿的功效，促进体内湿热之邪的排出，有助于缓解黄疸引起的皮肤、巩膜发黄等症状。
解毒止血方面
解毒作用体现：木棉花具有一定的解毒功效，可用于辅助治疗一些因热毒引起的病症。像对于蛇虫咬伤等情况，民间有时会用木棉花进行辅助解毒。将木棉花捣烂后外敷，能在一定程度上缓解蛇虫咬伤后的中毒症状。止血功效：在止血方面，木棉花可用于治疗外伤出血等情况。把木棉花研成粉末，外敷在出血的伤口处，能够起到一定的止血作用。不过，对于较严重的出血情况，还需结合其他更有效的医疗措施。
其他相关作用
对痢疾的缓解：木棉花对于痢疾也有一定的缓解作用。它可以帮助减轻痢疾患者的腹痛、腹泻、里急后重等症状。常与马齿苋等有止痢作用的药物一同使用，以增强治疗痢疾的效果。调节机体代谢：从现代医学角度推测，木棉花可能在调节机体代谢方面有一定作用。它所含的一些成分可能对人体的新陈代谢有一定的影响，有助于维持机体的正常生理功能。但具体的作用机制还需要进一步深入的科学研究来明确。