男性生殖器上有小泡泡，可能是以下原因引起：
1.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，主要通过性接触传播。初期为红斑，然后出现簇集性小水疱，很快破溃形成糜烂或浅溃疡，伴有疼痛。生殖器疱疹容易复发，需要及时就医，在医生的指导下使用抗病毒药物进行治疗。
2.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染引起，主要通过性接触传播。初期为淡红色或皮色的小丘疹，逐渐增大增多，最后成为菜花状、鸡冠状的赘生物。尖锐湿疣可以通过物理治疗、药物治疗、免疫疗法等方法进行治疗。
3.珍珠疹：是一种正常的生理变异，可能与包皮过长、局部刺激等因素有关。珍珠疹一般没有自觉症状，不需要特殊治疗。如果觉得影响美观，可以通过激光、冷冻等方法去除。
4.龟头炎：可由感染、局部刺激等因素引起。龟头炎会出现龟头红斑、丘疹、水疱等症状，伴有瘙痒、疼痛等不适。龟头炎需要根据病因进行治疗，如感染引起的需要使用抗生素，局部刺激引起的需要去除刺激因素。
5.其他：男性生殖器上有小泡泡还可能是过敏、湿疹、皮脂腺异位症等原因引起。
如果发现男性生殖器上有小泡泡，应及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意个人卫生，保持生殖器清洁干燥，避免搔抓，避免不洁性生活。