慢性咽炎多由多种因素长期作用引起，比如大约有50%的慢性咽炎患者是因为急性咽炎反复发作未彻底治愈转变而来。
局部因素导致
鼻腔、鼻窦疾病影响： 鼻腔和鼻窦的炎症分泌物会倒流至咽部，长期刺激咽部黏膜，引发慢性咽炎。例如，患有慢性鼻窦炎的患者，鼻窦内的脓性分泌物不断流向咽部，就容易导致咽部反复受到刺激，进而诱发慢性咽炎。咽部邻近器官病变： 像扁桃体炎、牙龈炎等咽部邻近器官的炎症，也可波及咽部，引起慢性咽炎。比如扁桃体反复发炎，炎症蔓延至咽部，长期刺激就会使咽部黏膜处于慢性炎症状态。
全身因素引发
呼吸道慢性炎症： 气管炎、支气管炎等呼吸道慢性炎症，其炎症分泌物可累及咽部。比如长期患有支气管炎的患者，气管内的炎性分泌物可能会向下蔓延至咽部，长期刺激咽部黏膜，导致慢性咽炎的发生。过敏因素： 过敏体质的人接触过敏原后，咽部黏膜可能发生过敏反应，出现慢性炎症。例如对花粉过敏的人，在花粉传播季节接触花粉后，咽部会出现瘙痒、不适等过敏症状，长期可发展为慢性咽炎。消化系统疾病： 胃食管反流病是常见的引发慢性咽炎的消化系统疾病。胃酸反流至咽部，会刺激咽部黏膜，导致咽部黏膜受损，引发慢性炎症。据统计，约有40%的慢性咽炎患者与胃食管反流病有关。
生活习惯及环境因素影响
不良生活习惯： 长期吸烟的人，烟草中的尼古丁等有害物质会刺激咽部黏膜，使咽部黏膜充血、水肿，容易引发慢性咽炎。另外，过度饮酒也会对咽部黏膜造成损伤，增加患慢性咽炎的风险。环境因素： 长期处于空气污染严重的环境中，如工业废气、汽车尾气等，空气中的有害颗粒和化学物质会刺激咽部黏膜。还有长期处于干燥、粉尘多的环境里，咽部黏膜容易受到损伤，从而诱发慢性咽炎。