中耳炎化脓时，常用的药物有抗生素类药物等。一般来说，可选用青霉素类或头孢类抗生素来治疗，如阿莫西林等，不过具体用药需遵医嘱。
抗生素类药物选择
青霉素类： 青霉素G对大多数革兰阳性菌、革兰阴性球菌、螺旋体等有较强的杀菌作用。但使用前需做青霉素皮试，若过敏则不能使用。头孢类： 头孢拉定等头孢菌素类药物对多种细菌有抗菌活性。不过要注意，对头孢菌素类药物过敏者禁用。
局部用药情况
滴耳液： 可使用过氧化氢溶液清洗化脓的耳朵，先将脓液清理干净，然后可选用氧氟沙星滴耳液等。但儿童使用时要谨慎，需在医生指导下，因为儿童的耳部结构特殊，用药不当可能会有不良影响。比如氧氟沙星滴耳液，18岁以下儿童使用时需权衡利弊。
特殊人群用药注意
儿童： 儿童患中耳炎化脓时，用药更要谨慎。比如在使用抗生素时，要根据儿童的体重等情况由医生调整剂量，避免使用可能影响儿童听力等的药物。而且局部用药时，要防止药物流入咽喉等部位引起不适。孕妇： 孕妇患中耳炎化脓用药需格外小心，很多药物可能会通过胎盘影响胎儿，所以必须在医生的严格评估下选择对胎儿影响最小的药物，不能自行随意用药。