药流的完全流产率一般在85%左右。不过，它是否流得干净会受到多种因素影响。
影响药流是否流干净的因素一：妊娠天数
妊娠49天内效果相对较好：在妊娠小于等于49天的早期宫内妊娠中，药流的完全流产率相对较高。因为此时孕囊大小合适，药物作用更容易使孕囊完整排出。妊娠天数过长影响效果：如果妊娠天数超过49天，孕囊相对较大，药流流干净的概率会降低。这是因为孕囊较大时，仅靠药物作用可能无法使孕囊完全排出体外。
影响药流是否流干净的因素二：个人体质
子宫位置异常者需注意：子宫过度倾屈的女性，药流时孕囊排出可能不太顺利，流干净的几率相对会受影响。比如子宫极度后屈的女性，孕囊排出路径可能不顺畅。对药物敏感程度不同：有些女性对药流药物敏感性差，服用药物后子宫收缩可能不足以将孕囊完整排出，导致药流不全。而对药物敏感的女性，药流流干净的可能性相对更高。
影响药流是否流干净的因素三：孕囊情况
孕囊形态不规则：如果孕囊本身形态不规则，药流时流干净的难度增加。因为不规则的孕囊可能不能通过药物作用顺利完整排出。多个孕囊情况：如果是多孕囊的情况，比如双胞胎等，药流流干净的几率会降低。多个孕囊需要子宫更好地收缩来排出，而这种情况子宫收缩往往难以使所有孕囊都完全排出。药流后需要密切观察阴道出血情况以及腹痛情况，一般在药流后1 - 2周需要进行B超复查，以确定是否流干净。如果药流后阴道出血时间长、出血量多，或者复查B超发现有残留，可能需要进一步处理，如清宫手术等。