小腹疼痛的原因有多种。比如女性生理期时，约有60% - 90%的女性会出现不同程度的小腹疼痛，这是因为生理期子宫内膜前列腺素含量增高，引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态而出现疼痛。
妇科疾病导致的小腹疼痛
盆腔炎： 女性盆腔内的器官如子宫、输卵管、卵巢等发生炎症时会引起小腹疼痛，常伴有阴道分泌物增多、异味等症状。一般病程较长，若不及时治疗可能会影响生育。宫外孕： 受精卵在子宫体腔以外着床称为宫外孕，其中输卵管妊娠较为常见。典型症状是停经后小腹疼痛，随后可能出现阴道不规则流血，若宫外孕破裂，会出现剧烈腹痛，甚至危及生命。
肠道问题引发的小腹疼痛
肠炎： 细菌、病毒等感染肠道可引起肠炎，出现小腹疼痛，多伴有腹泻症状，严重时可能出现脱水、电解质紊乱等情况。例如急性肠炎，发病较急，可能在进食不洁食物后数小时内发病。肠梗阻： 肠道内容物通过障碍可导致肠梗阻，表现为小腹疼痛、呕吐、停止排气排便等。肠梗阻有不同类型，如机械性肠梗阻多由肠道粘连、肿瘤等引起，绞窄性肠梗阻病情凶险，需紧急处理。
泌尿系统疾病造成的小腹疼痛
膀胱炎： 膀胱发生炎症时会引起小腹疼痛，常伴有尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。一般急性膀胱炎经及时治疗可好转，但若转为慢性膀胱炎则容易反复发作。输尿管结石： 输尿管内有结石时会引起小腹剧烈疼痛，疼痛常突然发作，呈绞痛样，还可能伴有血尿等症状。结石较小的可能通过大量饮水等方式排出，较大的结石则需要进行碎石等治疗。