抗凝药物常见的副作用主要有出血倾向，比如使用华法林等抗凝药时，约有1%~3%的患者可能出现严重出血事件，像消化道出血，表现为黑便、呕血等；还有可能出现皮肤瘀斑，轻微碰撞就容易出现大片瘀斑。
血液系统相关副作用
血小板减少：部分抗凝药物可能影响血小板的功能或数量，导致血小板减少。比如使用肝素类药物时，少数人可能出现血小板减少症，发生率约为1%~5%，严重时可能引发出血风险增加等问题。贫血：长期使用某些抗凝药物，可能对骨髓造血功能产生一定影响，虽然较为少见，但可能导致贫血，表现为面色苍白、乏力等症状。
胃肠道方面的副作用
胃肠道不适：像阿司匹林等抗凝药物，可能刺激胃肠道黏膜，引起恶心、呕吐、腹痛等症状。有研究显示，约10%~20%服用阿司匹林的患者会出现胃肠道不适反应，尤其是本身有胃肠道疾病的患者，症状可能更明显。消化道溃疡出血：长期使用抗凝药物，尤其是非甾体类抗凝药物，会增加消化道溃疡出血的风险。据统计，使用华法林的患者中，约有1%~5%会发生消化道溃疡出血事件，轻者可能仅有大便隐血，重者可出现大量呕血、黑便等严重情况。
皮肤及过敏相关副作用
皮肤过敏反应：部分人使用抗凝药物后可能出现皮肤过敏现象，表现为皮疹、瘙痒等。比如使用低分子肝素时，约有1%~3%的患者可能出现皮肤过敏反应，轻者停药后症状可缓解，重者可能需要进行抗过敏治疗。血管性水肿：少数情况下，使用抗凝药物可能引发血管性水肿，表现为皮肤下组织肿胀，常见于面部、口唇等部位，虽然发生率较低，但也需要引起重视，一旦出现应及时就医处理。