孕早期有褐色分泌物可能是先兆流产、宫外孕、葡萄胎等异常妊娠，也可能是宫颈息肉、宫颈癌前病变、宫颈癌等疾病导致的，还可能是孕酮低、劳累、同房等因素引起的。建议及时就医，进行相关检查，如超声、血HCG、孕酮等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意休息，避免劳累和同房，保持外阴清洁。
1.异常妊娠：
先兆流产：指妊娠28周前，先出现少量的阴道流血、继而出现阵发性下腹痛或腰痛，盆腔检查宫口未开，胎膜完整，无妊娠物排出，子宫大小与孕周相符。
宫外孕：指受精卵在子宫体腔以外着床，以输卵管妊娠最常见。主要表现为停经后阴道流血、腹痛，严重者可出现晕厥与休克。
葡萄胎：指妊娠后胎盘绒毛滋养细胞增生，间质高度水肿，形成大小不一的水泡，水泡间相连成串，形如葡萄。多发生于生育期年龄，停经后阴道流血为典型症状，多发生于停经后8-12周。
2.疾病：
宫颈息肉：是慢性宫颈炎表现的一种，来源于宫颈黏膜的息肉，表面有一层柱状上皮覆盖，有丰富的微血管，因而颜色鲜红、柔软、脆弱。轻轻触动就会出血，以至于经常发生感染而形成溃疡。
宫颈癌前病变：指宫颈不典型增生，是宫颈癌的癌前病变，与高危型HPV持续感染相关。宫颈癌前病变多无明显症状，或仅有阴道分泌物增多、接触性出血等宫颈炎的表现。
宫颈癌：早期多为接触性出血，中晚期为不规则阴道流血。出血量根据病灶大小、侵及间质内血管情况而不同，若侵袭大血管可引起大出血。年轻患者也可表现为经期延长、经量增多；老年患者常为绝经后不规则阴道流血。一般外生型较早出现阴道出血症状，出血量多；内生型较晚出现该症状。
3.其他因素：
孕酮低：怀孕后孕酮低可能会导致先兆流产，出现褐色分泌物。
劳累：怀孕早期如果过度劳累，可能会引起褐色分泌物。
同房：怀孕早期同房可能会刺激子宫收缩，导致褐色分泌物。
总之，孕早期有褐色分泌物是一种异常情况，需要引起重视。建议及时就医，进行相关检查，以确定原因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意休息，避免劳累和同房，保持外阴清洁。