吞咽困难可根据具体情况选择不同科室，若初步考虑是口腔、咽喉部疾病等引起，可先看耳鼻喉科；若怀疑是食管等消化道问题导致，可看消化内科；若考虑是神经系统病变引发吞咽困难，如脑卒中后出现吞咽障碍等，可看神经内科。
一、耳鼻喉科相关情况
当吞咽困难伴有咽喉部疼痛、异物感等，可能是咽喉部的炎症、肿瘤等疾病所致，这些情况需要耳鼻喉科医生通过喉镜等检查来明确诊断，比如急慢性咽炎、咽喉部息肉等都可能引起吞咽困难，此时应前往耳鼻喉科就诊。
二、消化内科相关情况
若吞咽困难同时伴有胸骨后疼痛、反酸、烧心等症状，很可能是食管方面的问题，像食管炎、食管狭窄、食管癌等，消化内科医生会通过胃镜等检查手段来排查食管的病变情况，所以这种情况建议看消化内科。
三、神经内科相关情况
对于一些有神经系统基础疾病的患者，比如有过脑卒中病史的人，出现吞咽困难可能是神经系统病变影响了吞咽相关的神经功能，此时需要神经内科医生来评估神经系统的状态，判断是否是神经病变导致的吞咽障碍，从而进行相应的诊治，这类患者应前往神经内科就诊。
吞咽困难可能涉及多种因素，及时准确选择相应科室就诊才能更好地明确病因并进行治疗，不同人群若出现吞咽困难，都应根据自身具体伴随症状等合理选择就诊科室。