孩子咽喉有疱疹，可能是疱疹性咽峡炎、手足口病、口腔炎等原因引起的，具体分析如下：
1.疱疹性咽峡炎：主要由肠道病毒感染引起，柯萨奇A组病毒是最常见的病原体。可通过飞沫、接触患儿口鼻分泌物、污染的手和物品等途径传播。常表现为发热、咽痛、咽峡部黏膜小疱疹和浅表溃疡。一般治疗包括注意口腔卫生、保持口腔清洁、多饮水、给予富含维生素的流质或半流质饮食等。对症治疗可使用利巴韦林、干扰素等抗病毒药物，发热时可使用对乙酰氨基酚或布洛芬等退烧药。
2.手足口病：由肠道病毒感染引起，主要通过密切接触患者的粪便、疱疹液、鼻咽分泌物、唾液等传播。患儿可出现发热，手、足、口腔等部位的皮疹、疱疹或溃疡。大多数患儿症状较轻，可在一周内自愈。治疗主要是对症处理，注意口腔和皮肤清洁，避免抓挠皮疹，预防感染。可使用利巴韦林、干扰素等抗病毒药物，有发热等症状时可使用退烧药。
3.口腔炎：可由细菌、病毒、真菌等感染引起，也可能与维生素或微量元素缺乏、免疫功能异常等有关。患儿可表现为口腔黏膜充血、水肿、糜烂、溃疡等，伴有疼痛，影响进食。治疗方法因病因而异，如细菌感染可使用抗生素，病毒感染可使用抗病毒药物，维生素缺乏可补充维生素，免疫功能异常可使用免疫调节剂等。同时，保持口腔清洁，局部可使用口腔溃疡散、冰硼散等药物。
孩子咽喉有疱疹时，建议及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持口腔清洁，避免食用辛辣、刺激性食物，多喝水，多休息。