月经后第三天同房是否会怀孕，主要与女性的月经周期和排卵时间有关。一般来说，怀孕的可能性较小，但不能完全排除。以下是一些可能的情况：
1.安全期：女性的月经周期通常为21天至35天，排卵日通常在下次月经来潮前的第14天左右。月经后第三天，可能处于安全期，此时卵子尚未成熟排出，怀孕的几率较低。
2.额外排卵：有些女性的排卵时间可能会提前或推迟，尤其是月经周期不规律的女性。在安全期内，仍有可能发生额外的排卵，导致怀孕。
3.精子存活时间：精子在女性体内可能存活2至3天。如果在排卵前有精子进入女性体内，仍有可能受孕。
需要注意的是，安全期避孕法并不十分可靠，因为排卵时间可能受到多种因素的影响而发生变化。此外，每个人的身体状况不同，生育能力也有所差异。
如果您担心怀孕，可以考虑以下措施：
1.紧急避孕药：在同房后72小时内服用紧急避孕药，可以降低怀孕的风险。但紧急避孕药不能作为常规避孕方法，且可能会引起月经紊乱等副作用。
2.常规避孕方法：使用避孕套、口服避孕药、宫内节育器等常规避孕方法，可以更有效地避免怀孕。
如果您对避孕或生育健康有更多的疑问，建议咨询医生或计划生育专家，他们可以根据您的具体情况提供更准确和个性化的建议。此外，保持良好的生殖健康习惯，如定期体检、避免不洁性行为等，也是重要的。