女性尿路感染主要是由细菌等病原体入侵泌尿系统引起的，其中大肠埃希菌是最常见的致病菌，约80%的尿路感染是由它导致的。
解剖结构因素
女性尿道短而直：女性的尿道长度一般在3-5厘米左右，相较于男性约18厘米的尿道短很多，这使得细菌更容易从尿道外口进入膀胱等泌尿系统部位。比如，女性尿道口靠近肛门，肛门周围的细菌更易被冲刷到尿道引发感染。尿道与阴道、肛门相邻：女性的尿道外口毗邻阴道和肛门，阴道内的菌群以及肛门周围的细菌很容易波及尿道。例如，性生活时可能会将阴道内的细菌挤压到尿道，增加感染风险；不注意肛门周围清洁，粪便中的细菌也可能污染尿道。
生理周期因素
经期卫生不佳：女性在月经期间，经血是细菌良好的培养基，若卫生巾更换不及时，会为细菌滋生提供有利环境。一般建议每2-3小时更换一次卫生巾，保持外阴清洁干燥。妊娠期：怀孕时，增大的子宫会压迫输尿管，导致尿液排出不畅，尿液在输尿管和肾盂内潴留，容易滋生细菌引发感染。据统计，妊娠期女性尿路感染的发生率比非妊娠期高2-3倍。
性生活因素
性生活摩擦与细菌带入：性生活过程中，会对尿道产生机械性摩擦，可能损伤尿道黏膜，同时还会将外部细菌带入尿道。比如，女性性生活后短时间内尿路感染发生率会有所升高，建议性生活前后双方都要清洗外阴，性生活后尽快排尿，利用尿液冲刷尿道减少感染机会。避孕方式影响：使用杀精子剂避孕的女性，杀精子剂可能会改变阴道内的菌群环境，使细菌更容易繁殖，从而增加尿路感染的发生概率。
局部免疫力下降因素
糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖较高，尿液中含糖量也高，为细菌生长提供了丰富的营养，同时高血糖会影响白细胞的杀菌功能，使局部免疫力降低。研究表明，糖尿病患者尿路感染的发生率比非糖尿病患者高2-3倍。长期使用免疫抑制剂者：比如器官移植后长期使用免疫抑制剂的患者，机体的免疫功能受到抑制，对病原体的抵御能力减弱，容易发生尿路感染。这类患者需要更加注意个人卫生，定期监测尿液情况。