一般情况下，月经初潮后2~7年内，因为卵巢功能尚未发育成熟，可能会出现月经周期不规律的现象，属于正常的生理现象。但如果16岁女生月经推迟时间过长，可能是以下原因所致：
1.怀孕：有性生活的16岁女生，当月经推迟10天以上，应考虑怀孕的可能。可通过验孕棒或到医院进行妊娠试验，以确定是否怀孕。
2.多囊卵巢综合征：这是一种常见的妇科内分泌疾病，以雄激素过高、持续无排卵、卵巢多囊改变为特征，常伴有胰岛素抵抗和肥胖。主要表现为月经失调（月经稀发或闭经）、多毛、痤疮、不孕等。可通过B超检查和激素六项检测来确诊。
3.高雄激素血症：如先天性肾上腺皮质增生、肾上腺肿瘤等疾病，可导致肾上腺分泌雄激素过多，从而出现高雄激素血症。高雄激素血症可影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，导致月经失调。
4.高泌乳素血症：泌乳素是一种由垂体分泌的激素，其主要功能是促进乳腺发育和泌乳。当血清泌乳素水平升高时，可抑制卵巢功能，导致月经失调、闭经、不孕等。高泌乳素血症的常见原因包括垂体泌乳素瘤、下丘脑病变、甲状腺功能减退等。可通过血清泌乳素测定、垂体MRI等检查来确诊。
5.卵巢功能减退：如果16岁女生的卵巢功能开始减退，分泌的雌激素和孕激素水平下降，就会导致月经推迟。卵巢功能减退的常见原因有遗传因素、自身免疫性疾病、化疗、放疗等。可通过激素六项检测和抗苗勒管激素（AMH）检测来评估卵巢功能。
6.其他：如过度节食、精神压力过大、剧烈运动、环境改变等，也可能导致月经推迟。
如果16岁女生出现月经推迟的情况，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应给予孩子足够的关心和支持，帮助孩子调整心态，积极配合治疗。