停经69天才长出孕囊，可能是以下原因导致的。
1.月经周期不规律：如果女性的月经周期较长，排卵时间较晚，孕囊可能会相对较晚才能在B超下看到。
2.受孕时间晚：虽然末次月经时间明确，但实际受孕时间可能比末次月经时间晚，孕囊的发育也会相应延迟。
3.胚胎发育不良：如果孕囊迟迟不长，或者出现卵黄囊后长时间没有胎芽、胎心出现，可能提示胚胎发育不良。
4.其他因素：如孕妇年龄较大、患有某些疾病（如多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症等）、接触有害物质等，也可能影响孕囊的发育。
需要注意的是，停经69天看到孕囊还需要结合其他检查结果（如血β-HCG、孕酮等）以及临床症状来综合判断。如果医生怀疑有异常情况，可能会建议进一步检查或随访。如果孕囊最终能够正常发育，出现胎芽和胎心搏动，一般来说问题不大。但如果一直没有孕囊或出现异常情况，可能需要采取相应的措施，如终止妊娠。
在备孕或怀孕期间，建议保持良好的生活习惯，注意休息，避免接触有害物质，按照医生的建议进行产前检查，以确保胎儿的健康发育。如果对孕囊的情况有任何疑问或担忧，应及时与医生沟通，以便获得更专业的建议和指导。