运动后头疼可能由多种原因引起。一般来说，运动时身体代谢加快，脑部供血、供氧等可能发生变化，从而引发头疼。比如，有研究发现，约20% - 30%的人在剧烈运动后会出现头疼症状。
一、体温变化导致的头疼
体温上升引发：运动时身体产热增加，体温会短暂升高。当体温升高到一定程度，可能会刺激头部血管，导致血管扩张，进而引起头疼。一般运动后体温升高幅度在1 - 2℃左右时，就可能出现这种情况。体温下降诱发：运动后如果马上吹冷风、进入空调房等，体温会快速下降，这也可能导致头部血管收缩，引发头疼。
二、脑部缺氧造成的头疼
剧烈运动耗氧多：像长跑、高强度间歇训练等剧烈运动，身体对氧气的需求大幅增加，脑部供氧相对不足时，就容易出现头疼。通常这种运动持续15分钟以上，就可能引发脑部缺氧性头疼。呼吸节奏紊乱：运动时呼吸节奏如果没有调整好，比如呼吸过浅、过快等，会影响氧气的摄入和二氧化碳的排出，进而导致脑部缺氧，引发头疼。
三、血压波动引起的头疼
运动后血压升高：运动时交感神经兴奋，血压会升高。对于一些原本就有血压问题或者血管调节功能不佳的人来说，血压升高可能会导致头疼。一般运动后收缩压可能会升高20 - 30mmHg左右。运动后血压下降：运动后如果血压下降过快，脑部灌注压降低，也会引起头疼。尤其是本身血压偏低或者运动后大量出汗导致血容量不足的人，更容易出现这种情况。