便血且肛门疼痛，可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，是一种常见的肛管疾病。典型表现为疼痛、便秘和便血。肛门视诊可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。治疗方法包括软化大便、局部坐浴、扩肛等，必要时行肛裂侧切术或肛管内括约肌切断术。
2.内痔：内痔发生脱垂、嵌顿，可导致肛门括约肌痉挛，进而引起疼痛。多有便后手纸带血或滴血，内痔发展到后期，可出现内痔痔核脱出。可采用注射疗法、胶圈套扎疗法等非手术治疗，或痔切除术等手术治疗。
3.肛管或直肠下段的肿瘤：肛管或直肠下段的良性或恶性肿瘤，随着肿瘤体积的不断增大，可发生溃破、感染，从而引起肛门疼痛、便血。肛管或直肠下段的超声、CT、磁共振成像（MRI）等检查有助于诊断肿瘤。一旦确诊为肛管或直肠下段的肿瘤，通常需要手术治疗，并根据肿瘤的性质、部位、大小等因素，决定是否需要进行放疗、化疗等辅助治疗。
4.其他：肛门部的感染、损伤、直肠炎、肛窦炎等，也可导致便血和肛门疼痛。
出现便血且肛门疼痛，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，应注意保持肛门局部清洁，避免食用辛辣、刺激性食物，养成良好的排便习惯，预防便秘。