乳腺囊肿的治疗需根据具体情况来定，一般较小的单纯性乳腺囊肿可能无需特殊治疗，定期观察即可，比如每3~6个月进行一次乳腺超声检查。
观察随访为主
无症状小囊肿：对于直径小于2厘米且没有明显症状的单纯性乳腺囊肿，通常建议每3~6个月进行乳腺超声复查，观察囊肿大小、形态等变化。周期性变化囊肿：部分乳腺囊肿会随月经周期出现大小变化，若没有不适症状，可先通过定期复查来监测。
手术治疗情况
囊肿较大或有可疑情况：当乳腺囊肿直径大于2厘米，或者超声等检查提示囊肿有可疑改变，如囊肿壁厚、内部回声不均匀等，可能需要手术治疗。手术方式一般为囊肿穿刺抽吸术，在超声引导下用空芯针将囊肿内的液体抽出，术后可能还需加压包扎。复发囊肿：如果囊肿穿刺抽吸后复发，且反复多次复发，也可考虑手术切除囊肿及周围部分乳腺组织，以明确病变性质并防止复发。
药物辅助缓解
对症止痛药物：当乳腺囊肿伴有乳房胀痛等症状时，可在医生指导下使用非甾体类抗炎药，如布洛芬等，来缓解疼痛不适，但药物只能起到对症缓解症状的作用，并不能消除囊肿。调节内分泌药物：对于与内分泌紊乱相关的乳腺囊肿，若存在明显内分泌失调表现，如月经不调等，可在医生评估下使用调节内分泌的药物，不过这类药物使用需谨慎，要根据个体内分泌情况来选择。