引起男童生殖器红肿、疼痛的原因较多，较为常见的有以下几种情况：
1.感染：包括细菌、病毒、真菌等感染，如龟头炎、尿道炎、睾丸炎等。
2.过敏：接触过敏原后，会引发过敏反应，导致生殖器红肿、疼痛。
3.损伤：外力撞击、过度摩擦、咬伤等，都可能导致生殖器损伤，引起红肿、疼痛。
4.炎症：如附睾炎、前列腺炎等炎症性疾病，也可能导致生殖器红肿、疼痛。
5.其他：包茎、包皮过长、精索静脉曲张等，也可能引起男童生殖器红肿、疼痛。
如果发现男童生殖器红肿、疼痛，家长应及时带孩子就医，进行详细的检查，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意保持孩子生殖器的清洁卫生，避免搔抓、摩擦，穿着宽松、舒适的内裤。
需要注意的是，对于一些特殊人群，如新生儿、幼儿、免疫功能低下者等，生殖器红肿、疼痛可能是严重疾病的表现，如败血症、脑膜炎等，需要引起高度重视，及时就医。
以上内容仅供参考，如有相关问题，请及时就医，以获得更好的医疗建议。