头部多普勒又称为经颅多普勒，
一、它可以检查颅外的血管是否存在狭窄和闭塞，比如说颈外动脉。
二、经颅多普勒还可以查颅内血管的狭窄和闭塞，特别是对大脑中动脉的血管情况，可以做出初步的评估。
三、头部多普勒还可以发现颅内动静脉畸形，以及是否存在着静脉瘘的情况。
四、脑多普勒还可以检查病人的血管是否存在痉挛，特别是蛛网膜下腔出血的病人，可以给予病人查脑多普勒，监测是否有脑血管痉挛的发生，以及对蛛网膜下腔出血患者后续的随访观察。
五、脑多普勒还可以用于检查脑内动脉是否存在微栓子，特别是一些头痛的患者，可以给予病人查发泡实验，如果监测有微栓子，必要的时候还可以查经食道超声等。
六、脑多普勒还可以用于发现颅内压增高，或者是脑死亡，因为当颅内压增高时，脑多普勒的频谱会发生一系列的改变。