在月经末期还有褐色分泌物时同房可能会对身体产生一些影响，具体如下：
1.感染：月经期间，子宫内膜脱落，子宫颈口张开，此时同房容易将细菌带入子宫，引起感染。褐色分泌物可能是血液残留，如果有细菌感染，可能会导致炎症，如盆腔炎、宫颈炎等。
2.子宫内膜异位症：在月经期间，同房时的刺激可能导致经血倒流，使子宫内膜碎片种植在子宫以外的部位，引发子宫内膜异位症。这可能会引起痛经、性交痛等不适症状。
3.免疫反应：同房时，男性的精液可能会引起女性的免疫反应，导致抗体产生。如果抗体攻击子宫内膜，可能会影响受精卵的着床和发育，导致受孕困难或习惯性流产。
4.月经失调：同房可能会影响女性的内分泌系统，导致月经失调。例如，同房时的刺激可能导致子宫收缩，使月经提前结束或延长。
5.其他不适：有些女性在月经末期可能会有下腹坠胀、腰酸等不适症状，此时同房可能会加重这些不适。
需要注意的是，每个人的身体状况和反应都不同，不是每个人在这种情况下都会出现问题。但为了保护自己的健康，建议在月经完全结束后再同房。如果在同房后出现异常症状，如发热、腹痛、白带异常、阴道出血等，应及时就医，进行检查和治疗。此外，还要注意性生活卫生，使用安全套可以减少感染的风险。如果有任何关于月经或性健康的疑虑，最好咨询医生的建议。