病毒性脑炎患者的脑脊液特点主要有以下几方面。一般来说，病毒性脑炎患者脑脊液压力多正常或轻度升高，可达到180mmH₂O以上。
外观特点
颜色方面： 多数病毒性脑炎患者的脑脊液外观呈无色透明状。但也有少数情况可能会稍有浑浊，不过一般不会出现明显的血色或者黄色。比如大部分患者脑脊液外观像正常的清水一样透明。透明度： 通常透明度较好，不像细菌性脑膜炎那样常呈明显浑浊状。这是因为病毒性脑炎主要是病毒感染引起的炎症反应，不像细菌感染会有大量脓性分泌物导致浑浊。
细胞计数特点
细胞总数变化： 脑脊液中的细胞总数会有升高，一般多在（10 - 500）×10⁶/L之间。其中以淋巴细胞为主，淋巴细胞计数可占白细胞总数的多数。比如常见的是淋巴细胞计数明显增多，可达到数十到数百×10⁶/L。白细胞分类： 淋巴细胞比例增高是病毒性脑炎脑脊液细胞计数的重要特点。与细菌性脑炎以中性粒细胞增高为主不同，病毒性脑炎时脑脊液中的中性粒细胞比例一般不高，淋巴细胞占优势。
生化指标特点
蛋白质含量变化： 脑脊液中的蛋白质含量会有轻度升高，一般在0.5 - 1.5g/L左右。但通常不会出现明显升高，不像化脓性脑膜炎那样蛋白质含量可显著增高，可达数克每升。糖和氯化物含量： 糖含量一般正常，多在2.5 - 4.4mmol/L之间；氯化物含量也通常正常，多在120 - 130mmol/L左右。这与细菌性脑膜炎时糖含量降低、氯化物可能也有变化不同，病毒性脑炎一般糖和氯化物水平基本维持正常范围。