颅内感染是中枢神经系统的严重疾病，导致患者的致残率、致死率都非常高，在治疗上一定要根据病原学的特点，选择抗菌的药物来进行，提高患者的治愈率，降低致死率，减少后遗症的发生。
在临床上根据患者的病原菌来选择用药，通过做脑脊液的检查明确病原菌，患者病原菌没有被明确的时候，要给予广谱的抗菌药物来进行治疗，首选的是青霉素G，能透过血脑屏障起到抗炎的作用，还要给予患者脱水降颅压的药物减轻脑水肿、脑积水的症状，同时针对患者高热的症状进行治疗。
所以颅内感染的用药治疗是综合的治疗，患者连续发热以及脑炎的症状消失后，三次细菌培养没有细菌生长，生化达标才能表明颅内感染被控制住。