胃溃疡与十二指肠溃疡有区别，发病部位不同，胃溃疡多发生在胃角、胃窦等部位，十二指肠溃疡主要在十二指肠球部；发病机制有差异，胃溃疡是胃黏膜防御机制减弱，十二指肠溃疡常与幽门螺杆菌感染及胃酸分泌过多相关；疼痛特点不一样，胃溃疡疼痛多在餐后半小时至1小时出现，空腹时缓解，十二指肠溃疡疼痛常为空腹痛，进食后缓解；胃镜下表现有别，胃溃疡多为圆形或椭圆形溃疡，边缘整齐，十二指肠溃疡多呈圆形或椭圆形，基底较干净。
发病部位差异
胃溃疡主要累及胃内黏膜，常见于胃的小弯侧等区域；十二指肠溃疡则聚焦在十二指肠起始部位，即十二指肠球部。
发病机制不同
胃溃疡往往是胃黏膜自身防御修复功能降低，无法抵御胃酸和胃蛋白酶的侵袭；十二指肠溃疡多与幽门螺杆菌感染密切相关，该菌会破坏十二指肠黏膜屏障，同时胃酸分泌异常增多也起重要作用。
疼痛特点不同
胃溃疡疼痛规律多为进食 - 疼痛 - 缓解，也就是进食后半小时到1小时左右出现疼痛，之后逐渐缓解；十二指肠溃疡疼痛规律常是疼痛 - 进食 - 缓解，多在空腹时发作，进食后疼痛能得到一定程度缓解。
胃镜表现不同
胃镜下观察，胃溃疡的溃疡面通常形状较规则，边缘比较整齐，底部可能有较干净的苔；十二指肠溃疡的溃疡多呈圆形或椭圆形，表面可能覆盖薄苔，周边黏膜充血水肿情况有其特点。