月经结束后小腹疼痛可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因：
1.排卵性腹痛：月经结束后一周左右，可能会出现一侧下腹轻微疼痛，这是由于排卵引起的，通常持续1-2天，可伴有少量阴道出血。
2.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位，可能会导致月经结束后小腹疼痛，疼痛可能会逐渐加重，还可能伴有性交痛、月经异常等症状。
3.盆腔炎：盆腔炎是指女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症，可能会导致月经结束后小腹疼痛，还可能伴有白带异常、发热等症状。
4.子宫肌瘤：子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，可能会导致月经结束后小腹疼痛，还可能伴有月经量增多、经期延长等症状。
5.其他：其他原因还包括宫颈炎、子宫内膜息肉等。
如果月经结束后小腹疼痛持续时间较长、疼痛程度较重或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，如B超、妇科检查等，以明确病因，并进行针对性治疗。
此外，对于一些特殊人群，如孕妇、哺乳期妇女、有性生活史的女性等，月经结束后小腹疼痛可能与怀孕、流产、宫外孕等情况有关，需要特别注意。如果出现此类情况，应及时就医，进行相关检查，以排除这些情况。
总之，月经结束后小腹疼痛可能是正常的生理现象，也可能是某些疾病的表现，需要根据具体情况进行分析和处理。如果疼痛持续时间较长或伴有其他不适症状，应及时就医，以便早期诊断和治疗。