怀孕42天做阴超看不到孕囊，可能是以下原因引起的：
1.生理因素：
排卵延迟：如果女性平时月经周期不规律，排卵时间延迟，受孕时间也会相应推迟，导致孕囊在阴超下显示较晚。
胚胎发育缓慢：受精卵着床后，胚胎的发育速度因人而异。有些胚胎可能会发育较慢，在怀孕42天时孕囊还较小，难以在阴超中看到。
2.病理因素：
宫外孕：受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，称为宫外孕。宫外孕时，孕囊无法在子宫内正常生长，阴超也无法看到孕囊。常见的宫外孕部位包括输卵管、卵巢、腹腔等。
生化妊娠：指精卵结合后没有在子宫内着床，随着月经一起流产的现象。虽然HCG水平升高，但超声检查看不到孕囊。
胎停育：胚胎发育到一定阶段后停止发育，B超检查显示孕囊不完整、无胎心搏动或胎芽。
3.其他因素：
孕囊位置：孕囊可能位于子宫角部、子宫颈管内或剖宫产切口瘢痕处，这些位置可能会影响阴超的观察。
超声技术：阴超的分辨率和操作人员的经验也可能影响孕囊的显示。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要结合临床症状、其他检查结果以及医生的经验进行综合判断。如果怀孕42天仍看不到孕囊，医生可能会建议进行进一步的检查，如血HCG测定、孕酮测定、腹部B超等，以明确孕囊的位置和发育情况。
在等待检查结果的过程中，孕妇应保持放松的心态，遵循医生的建议，注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。如果出现阴道流血、腹痛等异常情况，应及时就医。