肺微创手术相对传统开胸手术创伤小，但仍可能存在一些后遗症。一般来说，肺微创手术后的短期后遗症发生率相对较低，但仍需关注。
胸腔粘连相关情况
胸膜粘连： 肺微创手术过程中，胸腔内操作可能会引起胸膜反应，导致少量渗出，进而可能引发胸膜粘连。轻度的胸膜粘连可能没有明显症状，但如果粘连较严重，可能会在活动时出现胸部牵拉感。通常在术后康复过程中，部分患者通过适当的呼吸功能锻炼等可逐渐改善，但少数人可能长期存在胸部偶尔不适的情况。肺组织粘连： 手术也可能导致肺组织与周围组织发生一定程度的粘连，这可能会对肺的正常扩张产生一定影响，不过相比传统开胸手术，这种情况的发生率相对较低。一般通过术后规范的康复训练，如深呼吸、吹气球等，有助于减少肺组织粘连的不良影响。
呼吸道相关后遗症
气道反应性改变： 手术可能会对呼吸道产生一定刺激，部分患者在术后可能出现气道反应性增高的情况，表现为咳嗽，尤其是在受到冷空气、异味等刺激时，咳嗽可能会加重。一般这种情况会随着时间推移逐渐缓解，但有的患者可能需要数周甚至数月才能完全恢复正常的气道反应性。肺部感染风险： 虽然肺微创手术创伤小，但术后患者如果呼吸功能恢复不佳，痰液排出不畅，仍有发生肺部感染的可能。不过相比传统开胸手术，其发生肺部感染的概率要低很多。一般术后医生会鼓励患者积极咳嗽、咳痰，进行呼吸训练等，以降低肺部感染风险。
切口相关后遗症
切口疼痛： 手术切口处可能会有不同程度的疼痛，一般术后短期内较为明显，随着时间推移会逐渐减轻。但少数患者可能会出现切口慢性疼痛，尤其是一些对疼痛较为敏感的人群，或者切口恢复过程中出现异常情况时。通常可以通过适当的止痛措施以及康复理疗等进行缓解。切口瘢痕： 术后切口会形成瘢痕，多数人的瘢痕会逐渐变平、颜色变淡，但少数人可能会出现瘢痕增生，表现为切口处瘢痕隆起、变红、变硬等，可能伴有瘙痒等症状。一般可以通过使用抑制瘢痕增生的药物等方法来改善瘢痕情况。