细菌和病毒引起的发烧有一些区别。一般来说，细菌感染引起的发烧，体温可能更高，常常超过38.5℃，而且可能持续时间相对较长；病毒感染引起的发烧，体温多在38℃左右，可能会有波动，但相对细菌感染来说，体温上升幅度没那么大。
体温表现特点
细菌感染发烧：细菌感染引发的发烧，体温升高比较明显，有的时候能达到39℃甚至更高，而且发热持续时间相对较长，比如肺炎由细菌感染引起时，发烧可能会持续3 - 5天甚至更久。病毒感染发烧：病毒感染导致的发烧，体温多在38℃上下，不过体温波动相对大一些，可能上午体温稍低，下午稍高，但一般不会超过39℃太多，像普通感冒病毒引起的发烧，大多持续1 - 3天。
伴随症状差异
细菌感染伴随症状：细菌感染时，除了发烧，往往还会有一些局部感染的表现，比如细菌引起的尿路感染，可能会有尿频、尿急、尿痛的症状；肺部细菌感染会有咳嗽、咳痰，痰可能是脓性的。病毒感染伴随症状：病毒感染引起的发烧，伴随症状多以全身症状为主，像病毒引起的流感，会有全身酸痛、乏力比较明显，局部症状相对没那么突出，咳嗽可能是清稀的痰。
血液指标变化不同
细菌感染血液指标：做血常规检查时，细菌感染导致发烧，通常会出现白细胞计数升高，中性粒细胞百分比也会升高。比如细菌性扁桃体炎，白细胞可能会超过10×10⁹/L，中性粒细胞比例大于70%。病毒感染血液指标：病毒感染引起发烧，血常规检查一般是白细胞计数正常或降低，淋巴细胞百分比会升高。例如普通病毒性感冒，白细胞可能在正常范围，淋巴细胞比例可能超过40%。