百多邦的主要成分是莫匹罗星，红霉素软膏的主要成分是红霉素，二者都是常用的外用抗生素类药物，但在适用情况等方面有差异。一般来说，百多邦对于革兰阳性球菌引起的皮肤感染效果较好，比如毛囊炎、疖肿等，而红霉素软膏对革兰阳性菌、部分革兰阴性菌以及支原体、衣原体等有抗菌作用。通常百多邦的价格相对红霉素软膏会稍高一些，大概在10~30元左右一支，红霉素软膏价格更亲民，一般几元到十几元一支。
适用范围差异
百多邦：主要针对革兰阳性球菌感染，像金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌等引起的皮肤感染。比如小朋友玩耍时不小心擦伤皮肤，引发局部细菌感染出现红肿、化脓等情况，用百多邦能较好抑制细菌生长。红霉素软膏：除了对革兰阳性菌有作用外，对沙眼衣原体、肺炎支原体等也有一定抑制作用。像一些轻度的痤疮，由痤疮丙酸杆菌等细菌感染引发，红霉素软膏有一定辅助治疗作用。
药物剂型与使用感受
百多邦：剂型为乳膏状，质地相对细腻，涂抹后在皮肤表面形成的薄膜较薄，感觉比较清爽，不太会有油腻感。红霉素软膏：也是乳膏状，但有的品牌红霉素软膏可能质地相对略稠一些，涂抹后短时间内可能会有稍微油腻的感觉，不过很快会被皮肤吸收。
不良反应情况
百多邦：不良反应较少见，少数人可能会出现局部烧灼感、蛰刺感等轻微不适，但一般比较轻微，多数人都能耐受。红霉素软膏：个别人可能会出现用药部位的刺激症状，如灼烧感、瘙痒、红肿等，不过发生概率相对较低。如果出现严重的不良反应，如局部红肿加重、瘙痒剧烈等，应及时停药并清洗局部药物。
特殊人群注意事项
儿童使用：儿童使用时，百多邦和红霉素软膏都要注意避免涂抹在眼睛、口腔等黏膜部位。对于婴幼儿的皮肤感染，使用前最好先咨询医生，根据孩子具体情况选择更合适的药物。一般来说，两岁以上儿童在符合用药指征时可以使用，但都要谨慎操作。孕妇及哺乳期女性：孕妇和哺乳期女性使用这两种药物时，也需要谨慎。最好在医生指导下使用，因为虽然它们是外用药物，但为了安全起见，还是要评估用药的必要性和安全性。比如孕妇皮肤有感染情况，需要权衡使用百多邦或红霉素软膏对自身和胎儿的影响。