怀孕40天时感冒吃药是否会致胎儿畸形，需要具体情况具体分析，不能一概而论。
怀孕早期（前3个月）是胎儿器官形成的关键时期，此时孕妇服用药物可能会对胎儿产生影响。但并非所有的感冒药都会导致胎儿畸形，这取决于药物的种类、剂量、使用时间以及孕妇的个体差异等因素。
以下是一些需要考虑的因素：
1.药物种类：某些药物，如利巴韦林、抗病毒药物等，可能会对胎儿有致畸风险。而一些常见的感冒药，如解热镇痛药（对乙酰氨基酚）、抗过敏药等，在医生的指导下使用时，通常是安全的。
2.剂量和使用时间：药物的剂量和使用时间也很重要。如果孕妇在怀孕早期不小心服用了致畸风险较高的药物，但剂量较小或使用时间较短，胎儿可能不会受到明显影响。然而，如果药物剂量较大或使用时间较长，胎儿畸形的风险可能会增加。
3.孕妇个体差异：每个孕妇对药物的代谢和反应都可能不同。一些孕妇可能对某些药物更敏感，而另一些孕妇可能相对较耐受。此外，孕妇的健康状况、遗传因素等也可能影响胎儿的安全性。
如果在怀孕40天时感冒并服用了药物，应采取以下措施：
1.及时就医：咨询医生，告知医生怀孕情况和服用的药物，医生会根据具体情况进行评估，并提供个性化的建议。
2.产前检查：按照医生的建议进行产前检查，包括唐氏筛查、超声检查等，以监测胎儿的发育情况。
3.注意观察：密切关注自身和胎儿的健康状况，如出现异常症状，如阴道流血、腹痛等，应及时就医。
需要强调的是，预防感冒比治疗更重要。在怀孕期间，应注意保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、充足睡眠等，以增强免疫力。此外，避免接触感染源、勤洗手、戴口罩等也有助于预防感冒。
如果对怀孕早期的用药安全性存在疑虑，建议与医生进行充分的沟通，共同做出明智的决策。医生会根据具体情况权衡利弊，提供最适合的建议和处理方案。同时，孕妇也应该保持冷静和积极的态度，遵循医生的指导，以确保胎儿的健康。