一，全病程治疗原则。抑郁障碍的复发率高达50%到85%，其中50%的患者在疾病发生以后的两年内复发。因此，提倡全病程治疗，包括急性期、巩固期和维持期治疗。
二，个体化合理用药原则。应该根据临床因素，对抗抑郁药进行个体化的治疗。比方说考虑药物疗效和不良反应的性别差异来选择，有的种类考虑不同年龄患者的代谢差异，调整药物剂量。
对于有自杀观念的患者，避免一次储藏大量药物防止意外，考虑患者既往用药的情况，优先选择过去药物治疗，疗效比较满意的一些药。
三，量化评估原则。治疗前对疾病症状诊断以及特点，治疗和影响治疗的躯体情况，患者的主观感受、社会功能、生活质量以及经济负担等情况，进行一个充分的评估。
治疗过程中，定期应用一些实验室检查和精神科的量表，进行疗效、耐受性、安全性方面的量化评估。
四，抗抑郁药单一使用原则。通常抗抑郁药尽可能的单一使用，对于难治性抑郁，可以联合用药增加它的疗效。
五，药物剂量调整原则。结合耐受性评估，选择一些比较适宜的起始剂量。根据它的药物动力学特点，制定一个适宜的药物滴定速度，通常都是在一到两周内，达到有效的剂量。
第六，注意它的停药原则。也就是停药一定要缓慢减量，注意评估病情和减量或者是停药后的症状表现。