来月经一般不影响办理健康证。健康证的办理主要是为了检查申请人是否患有某些可能会传染给他人的疾病，例如肺结核、伤寒、甲型病毒性肝炎、戊型病毒性肝炎等。而月经是女性的正常生理现象，不会导致这些疾病的传播。
但需要注意的是，办理健康证可能需要进行一些体检项目，如胸透、采血等。如果月经量较多，可能会影响体检结果，导致一些指标异常。此外，如果在月经期间进行妇科检查，可能会导致感染或其他不适。
因此，如果你的月经期间身体不适，建议在月经结束后再去办理健康证。同时，在办理健康证前，最好咨询当地的体检机构或相关部门，了解具体的要求和注意事项。