小三阳肝区隐痛的原因可能有以下几点：
1.肝脏炎症：小三阳通常是指乙肝小三阳，即乙肝表面抗原、乙肝e抗体和乙肝核心抗体阳性。如果乙肝病毒复制活跃，可能导致肝脏炎症，进而引起肝区隐痛。
2.肝脏纤维化或肝硬化：长期的乙肝感染可能导致肝脏纤维化和肝硬化，肝脏质地变硬，肝脏包膜受到牵拉，从而引起肝区隐痛。
3.药物性肝损伤：某些药物可能对肝脏造成损伤，导致肝区隐痛。如果正在服用某些药物，需要咨询医生是否与肝区隐痛有关。
4.其他肝脏疾病：除了乙肝小三阳，还有其他肝脏疾病可能导致肝区隐痛，如脂肪肝、药物性肝损伤、自身免疫性肝病等。
5.胆囊疾病：胆囊位于肝脏下方，如果胆囊有炎症、结石等问题，可能会引起右侧上腹部（肝区附近）疼痛，疼痛可能会放射到右肩部。
6.心理因素：心理压力、焦虑、抑郁等情绪问题也可能导致肝区不适或隐痛的感觉，但这种情况通常与肝脏本身的疾病无关。
需要注意的是，肝区隐痛也可能是其他部位疾病引起的牵涉痛，如胸膜炎、肋间神经炎等。如果小三阳患者出现肝区隐痛，建议及时就医，进行全面的检查，如肝功能、乙肝病毒DNA定量、肝脏超声等，以确定具体原因，并采取相应的治疗措施。
在就医检查之前，应注意休息，避免饮酒和过度劳累，保持良好的心态。同时，遵循医生的建议进行治疗和随访，定期复查肝功能和乙肝病毒标志物，以监测病情的变化。