喉咙根部锁骨处有异物感、刷牙时恶心，可能与以下几种疾病有关：
1.慢性咽炎：
是咽部黏膜、黏膜下及淋巴组织的慢性炎症。
主要症状为咽部异物感、痒感、灼热感、干燥感或微痛感。
常因刷牙或吞咽动作而引起恶心。
2.胃食管反流病：
是胃内容物反流至食管和（或）口腔，导致不适症状和（或）并发症的一种疾病。
典型症状为烧心、反流，还可能出现咽部异物感、吞咽困难、胸骨后疼痛等。
部分患者可因反流物刺激咽部而引起咳嗽、咳痰、恶心等症状。
3.咽部异感症：
是一种临床常见的疾病，患者自觉咽部有异物感，如同梅核堵塞，咯之不出，咽之不下，但不妨碍进食。
病因尚不明确，可能与精神因素、神经官能症、焦虑、抑郁等有关。
4.其他：
扁桃体肥大、鼻后滴漏综合征、食管癌等也可能导致类似症状。
如果出现喉咙根部锁骨处有异物感、刷牙时恶心的症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。同时，应注意保持口腔清洁，避免食用辛辣、刺激性食物，避免过度用嗓。